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質粒純化新策略:從結構解析到層析技術的全流程優化

時間:2025-06-05 14:23:50 點擊數:

在基因治療、mRNA疫苗與細胞治療的黃金時代,質粒DNA作為核心載體,其純化技術正迎來前所未有的挑戰與機遇如何高效獲取高純度超螺旋質粒?本文將從質粒特性、雜質控制到層析技術創新,為您揭秘關鍵工藝

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質粒:基因時代的“運輸車”

質粒(pDNA)是存在于微生物中的環狀雙鏈 DNA 分子,以超螺旋(scDNA)、開環(ocDNA)和線性(L-DNA)三種構型存在。其中,超螺旋結構因活性最高、轉染效率最優,成為基因治療與疫苗載體的 “理想形態”,生產中要求其占比≥80%。作為基因工程的核心工具,它不僅能攜帶外源基因實現擴增表達,更可搭載 CRISPR-Cas9 進行基因編輯,或直接作為 mRNA 疫苗載體誘導免疫反應,在醫藥、農業等領域應用廣泛。

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Figure 1. 質粒DNA的三種分?構型


02

純化難點:異構體和雜質的"雙重考驗"

質粒常用大腸桿菌制備,生產過程中異構體和雜質的控制是確保產品質量的關鍵。

分離scDNA是大規模純化用于DNA疫苗和基因治療的pDNA載體的關鍵,?產中要求占比≥80%。

主要雜質類型有宿主細胞蛋白(HCP)、宿主細胞RNA(HC-RNA)、宿主基因組DNA(HC-DNA)等、質粒聚集體、內毒素及化學試劑殘留等。

03

層析技術:精準分離的"核心武器"

多種層析方法可用于純化pDNA:

? 凝膠過濾基于分子量分離,但通量低。

? 親和層析:對scDNA具有較?的選擇性。
? 疏水層析:通過鹽濃度梯度分離scDNA與ocDNA。scDNA因堿基暴露程度更高,疏水性顯著強于其他異構體,在高鹽(如3M硫酸銨)條件下,scDNA與疏水填料的疏水相互作用增強,結合更緊密。而ocDNA因單鏈斷裂導致結構松散,疏水性降低;線性質粒則因雙鏈完全解旋,疏水性進?步減弱。這些異構體在高鹽條件下無法有效結合填料,通過梯度洗脫(如降低鹽濃度至1M)即可被去除

? 陰離子交換層析:去除痕量雜質,如內毒素和HCP。

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Figure 2. 質粒DNA三步純化方案


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Figure 3. 質粒DNA兩步純化方案一

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Figure 4. 質粒DNA兩步純化方案二


兩步純化法可實現更高的上樣量、回收率和更快的流速,縮短工藝時間,減少試劑耗材用量和成本,提高質粒純化效率。

Crysto Shell系列復合模式層析填料同時具有分子篩和陰離子交換層析功能,且采用流穿模式進行純化,因此具有較高的處理通量。

MoSphere 50V系列超大孔填料,采用親水性聚甲基丙烯酸酯(PMMA)為基質,其4000?超大孔徑的設計,可以使更多的大尺寸生物分子進入填料孔道內部進行結合,輕松實現高載量、高流速、高效率的純化。

質粒的生產制備需通過多步驟層析及嚴格質控,創新分離技術,平衡產量、純度與成本,以滿足基因治療和疫苗開發的高標準要求,是質粒純化工藝開發一直追求的目標。

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科諾賽的超大孔色譜分離技術,顯著優化了基因治療藥物和mRNA疫苗的下游純化工藝流程,不僅降低了生產成本、提高了生產效率,而且為整個生物制藥行業的快速發展奠定了堅實的技術基礎。



MoSphere 50V DEAE 產品一覽

MoSphere? 50V DEAE 超大孔弱陰離子交換層析介質,專為超大尺寸復雜生物大分子的分離純化需求而設計,產品借助特有的表面修飾技術, 將離子交換官能團鍵合在親水性基質表面,制備出弱陰離子交換(DEAE)層析介質。

應用領域:質粒、大核酸、VLP 顆粒、狂犬病毒、慢病毒的分離純化。

產品特點

?高結合載載量是常規瓊脂糖層析介質的 10 倍以上,是常規聚合物層析介質的 2 倍;

?高回收率可保持大分子蛋白或病毒結構的完整性,得到高收率、高活性的目的蛋白;

?高分辨率、高柱效分子傳質速度快,蛋白或病毒顆粒可輕松進入孔內結合;

?非特異性吸附低微球表面進行親水化改性,可解決某些疏水性強的蛋白或者病毒導致的強吸附問題。


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參考?獻

1.H. Bo et al. Using a single hydrophobic-interaction chromatography to purify pharmaceutical-grade s u p e r c o i l e d p l a s m i d D N A f r o m o t h e r isoforms. J.Pharmaceutical Biology, 2013; 51(1): 42–48

2.M.L. Yu, M.R. Yu, F. Qian, Purification of plasmid DNA using a novel two stage chromatography process.Journal of Chromatography B 1250 (2025). https://doi.org/10.1016/j.jchromb.2024.124381


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